Créé en 2001, dirigé successivement par les professeurs Guillaume Drago, Stéphane Rials et Jean-Jacques Bienvenu, l’Institut Cujas est organisé sous la forme d’une structure fédérative ayant vocation à apporter un soutien logistique, matériel et financier aux entités qui le composent afin que celles-ci puissent se concentrer uniquement sur leur politique scientifique et leurs activités de recherche.